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2023-10-30 阅读(267)
(gene overexpression)是将目的基因编码区序列(CDS)克隆到相应的质粒或病毒载体上,利用载体骨架上构建的调控元件,使基因可以在人为控制的条件下实现大量转录和翻译,从而实现目的基因的过表达。此外,还可选择报告基因进行示踪或抗性基因进行筛选。
过表达技术可以用于筛选新的基因功能和标靶药物,常用的病毒载体有腺相关病毒载体、慢病毒载体、腺病毒载体和逆转录病毒载体等,广泛应用于体外和体内基因功能研究。
一.DNA重组技术进行基因过表达实验步骤
1.扩增目的基因:将含有目的基因的载体与慢病毒载体进行LR重组反应。采用8μL体系,其中pENTR 3c dual 100 ng、pLenti6.3/V5-DEST 1 μL、LR重组酶混合物2 μL、补加TE缓冲液至8μL,置于25C水浴锅,过夜,培养12-16h。然后将过夜培养的重组质粒1μL加入10μL的TOP10感受态中进行转化、挑克隆、摇菌。
2.目的基因与真核表达载体的重组连接:提取质粒并进行酶切验证所得质粒是否准确导入目的基因。采用20μL酶切体系对目的片段进行酶切;酶切后的基因片段进行琼脂糖凝胶电泳,将含有目的基因的凝胶回收;回收所得目的基因与pcDNA 4.0进行重组连接。取pcDNA 4.0、目的基因、连接酶,16°C放置10 h;将全部连接产物加入100 μL Top10感受态做转化;所得产物进行酶切后通过琼脂糖凝胶电泳验证。
3.序列测定:挑取阳性克隆,提取目的基因进行NCBI-blast匹配检测序列,排除重组过程中对的基因突变。
4.细胞转染:将重组成功的真核表达质粒载体pcDNA4.0-14-3-3θ转染293T细胞。将2x 10个293T细胞于前一晚铺于6 cm平皿中;用Lip2000 15 μL、重组真核表达质粒6 μL和无血清的培养液进行转染;6h后换含10%血清的培养液,72h后收蛋白,采用western-blot进行目的蛋白高表达的验证。
5.过表达目的蛋白的细胞株的筛选与验证:将含有目的基因的重组质粒和pcDNA4.0-cherry分别细胞。转染体系和条件与上述转染过程相同,转染72 h后用含zeocin 100 μg/mL的培养液进行筛选,三周后所得细胞克隆提取蛋白,用western-blot进行目的蛋白水平高表达的验证;提取RNA,进行Real-time RT-PCR进行mRNA水平蛋白高表达的验证。
二.CRISPRa基因过表达技术
2.1 技术原理
CRISPRa系统通过在sgRNA与Cas9蛋白之间连接一个转录激活域,使其靶向特定的启动子区段或增强子区域,上调基因的转录活性,实现基因表达的激活。
2.2 关键要素
CRISPRa系统主要是由特异性sgRNA和Cas9-转录激活域融合蛋白构成,转录激活域通常选用VP64或p65AD等,通过连接子与Cas9 C端链接。sgRNA设计需要选择靶基因的启动子或增强子区段。CRISPRa方法一般适用于不能直接外源过表达的大基因。
2.3 实验步骤
(1)构建Cas9-激活域融合表达载体和sgRNA表达载体;
(2)转染表达载体到细胞中,实现CRISPRa在细胞内的表达;
(3)提取RNA,使用qPCR判断靶基因mRNA表达量的变化,确认基因激活效果。
(4)相较于对照组,靶基因mRNA水平显著上调,则实验成功。
三.CRISPRa与ORF传统过表达技术的对比
|
CRISPRa |
ORF传统过表达技术 |
组件数量 |
≥2 |
1 |
过度表达程度 |
可通过复用sgRNA或激活剂结构域实现高表达 |
可实现高表达 |
特异性 |
很高,但要注意双向启动 |
很高 |
受长ORF限制 |
否 |
是 |
剪接异构体的差异过表达 |
否 |
是 |
与宿主细胞基因型不匹配的变体的表达 |
否 |
是 |
四.过表达三类载体的特点及适应性
常规蛋白表达 |
非编码RNA表达 |
毒性蛋白表达 |
常规的蛋白表达的同时可以为蛋白表达添加融合或非融合的荧光标签,亲和标签,亚细胞定位系列等一系列修饰 |
与常规蛋白表达不同的是,由于非编码RNA(链接非编码RNA介绍)仅仅转录但不翻译,无蛋白产生,因此此类表达载体(尤其是lncRNA)最好独立表达荧光蛋白,且常规蛋白表达的修饰基本不能使用。目前常见的非编码RNA主要为microRNA、lncRNA、circRNA三大类表达载体与之对应 |
细胞毒性蛋白表达与常规蛋白表达的载体除少量修饰外并无在明显区别,但在AAV载体制备过程中对表达的毒蛋白进行抑制才能产生。此载体主要用于过表达各种对细胞有毒害的蛋白 |
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